Modélisation numérique de l'électrophysiologie cardiaque au niveau de la cellule

Le projet européen MICROCARD vise à construire un logiciel capable, grâce à l'utilisation des futurs supercalculateurs exaflopiques, de simuler le comportement électrique d'un cœur entier modélisé cellule par cellule. Ce projet est financé par EuroHPC à travers de l'appel Towards Extreme Scale Technologies and Applications.

Résumé

La contraction cardiaque est coordonnée par un système complexe d'activation électrique. Des anomalies structurelles du myocarde, même microscopiques, désorganisent cette activation et peuvent avoir des conséquences graves, allant jusqu'à la mort subite, y compris chez des sujets jeunes et apparemment sains. La modélisation numérique est un élément clé pour la compréhension de ces événements. L'étude d'un tissu anormal demande cependant une description individuelle des cellules et donc des calculs d'une complexité telle qu'on ne peut espérer réaliser ces calculs que sur la prochaine génération de supercalculateurs, dits «exaflopiques». Le but de ce projet est de développer des outils permettant de bénéficier de ces machines pour simuler l'activité électrique d'un cœur entier mais décrit cellule par cellule. Le projet regroupe des mathématiciens, informaticiens, biophysiciens, et ingénieurs biomédicaux. Il constitue un cas test pour les méthodes de pointe en simulation numérique et renforce la lutte contre les maladies cardiaques.

Financement

Logotypes de l'Agence Nationale de Recherche,
 du Research Council of Norway, du German
 Federal ministry of education and research, du EuroHPC joint union, de l'union européenne,
 du Ministero dello sviluppo economico, de la confédération suisse, et du FFG

LinkedIn: @project MICROCARD

Twitter: @P_Microcard

Latest news

25 November 2024: new open positions

As our new Centre of Excellence is taking off, two positions are open on our jobs page. There are more to come next month or next year!

MICROCARD restarts in November 2024

The MICROCARD project ended on 30 September but MICROCARD will be reborn as a Centre of Excellence on 1 November 2024. It will be funded by EuroHPC call HORIZON-EUROHPC-JU-2023-COE-03.

25 September 2024: Thesis defense Arun Thangamani

Arun Thangamani successfully defended his thesis "Optimized Code Generation of Parallel and Polyhedral Loop Nests using MLIR" at the University of Strasbourg. This is the first thesis supported completely by the MICROCARD project.


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Agenda

Thursday 5 December

16:00 MICROCARD-2 Executive Board meeting

Friday 13 December

10:00 (!) monthly WP1 technical meeting

Tuesday 17 December

15:00 Monthly WP2+3 meeting

Wednesday 18 December

Castiel-2 and HPC3 meetings


full agenda

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