Modélisation numérique de l'électrophysiologie cardiaque au niveau de la cellule

Le projet européen MICROCARD vise à construire un logiciel capable, grâce à l'utilisation des futurs supercalculateurs exaflopiques, de simuler le comportement électrique d'un cœur entier modélisé cellule par cellule. Ce projet est financé par EuroHPC à travers de l'appel Towards Extreme Scale Technologies and Applications.

Résumé

La contraction cardiaque est coordonnée par un système complexe d'activation électrique. Des anomalies structurelles du myocarde, même microscopiques, désorganisent cette activation et peuvent avoir des conséquences graves, allant jusqu'à la mort subite, y compris chez des sujets jeunes et apparemment sains. La modélisation numérique est un élément clé pour la compréhension de ces événements. L'étude d'un tissu anormal demande cependant une description individuelle des cellules et donc des calculs d'une complexité telle qu'on ne peut espérer réaliser ces calculs que sur la prochaine génération de supercalculateurs, dits «exaflopiques». Le but de ce projet est de développer des outils permettant de bénéficier de ces machines pour simuler l'activité électrique d'un cœur entier mais décrit cellule par cellule. Le projet regroupe des mathématiciens, informaticiens, biophysiciens, et ingénieurs biomédicaux. Il constitue un cas test pour les méthodes de pointe en simulation numérique et renforce la lutte contre les maladies cardiaques.

Financement

Logotypes de l'Agence Nationale de Recherche,
 du Research Council of Norway, du German
 Federal ministry of education and research, du EuroHPC joint union, de l'union européenne,
 du Ministero dello sviluppo economico, de la confédération suisse, et du FFG

LinkedIn: @project MICROCARD

Twitter: @P_Microcard

Latest news

21-26 July 2024: 16th World Congress on Computational Mechanics, Vancouver

Our delegation at the 16th World Congress on Computational Mechanics and 4th Pan American Congress on Computational Mechanics WCCM 2024 - PANACM 2024 has spread MICROCARD achievements among research scientists working in computational mechanics.

Talks by Ngoc Mai Monica Huynh and Fatemeh Chegini focused on MICROCARD work on preconditioners, solvers and data compression, which are among the core points of the project. Luca Pavarino and Rolf Krause presented recent work on nonlinear solvers and nonlinear preconditioners for cardiac applications.

24-26 June 2024: MICROCARD summer school in Oslo

In collaboration with Simula Research Laboratories, MICROCARD organized a summer school in Oslo to teach students about its backgrounds and results.

6 May 2024: MICROCARD-2!

Our proposal for MICROCARD to continue as a "Center of Excellence" leads the ranking for the call HORIZON-EUROHPC-JU-2023-COE-03 and is now in the negotiation stage. This will give us the chance to build on our project results and test our software on actual exascale supercomputers.


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Agenda

30 August - 2 September

European Society of Cardiology meeting in London

Wednesday 4 September

11:00 WP3 meeting

4-6 September

Virtual Physiological Human (VPH) meeting in Stuttgart


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