Modélisation numérique de l'électrophysiologie cardiaque au niveau de la cellule

Le projet européen MICROCARD vise à construire un logiciel capable, grâce à l'utilisation des futurs supercalculateurs exaflopiques, de simuler le comportement électrique d'un cœur entier modélisé cellule par cellule. Ce projet est financé par EuroHPC à travers de l'appel Towards Extreme Scale Technologies and Applications.

Résumé

La contraction cardiaque est coordonnée par un système complexe d'activation électrique. Des anomalies structurelles du myocarde, même microscopiques, désorganisent cette activation et peuvent avoir des conséquences graves, allant jusqu'à la mort subite, y compris chez des sujets jeunes et apparemment sains. La modélisation numérique est un élément clé pour la compréhension de ces événements. L'étude d'un tissu anormal demande cependant une description individuelle des cellules et donc des calculs d'une complexité telle qu'on ne peut espérer réaliser ces calculs que sur la prochaine génération de supercalculateurs, dits «exaflopiques». Le but de ce projet est de développer des outils permettant de bénéficier de ces machines pour simuler l'activité électrique d'un cœur entier mais décrit cellule par cellule. Le projet regroupe des mathématiciens, informaticiens, biophysiciens, et ingénieurs biomédicaux. Il constitue un cas test pour les méthodes de pointe en simulation numérique et renforce la lutte contre les maladies cardiaques.

Financement

Logotypes de l'Agence Nationale de Recherche,
 du Research Council of Norway, du German
 Federal ministry of education and research, du EuroHPC joint union, de l'union européenne,
 du Ministero dello sviluppo economico, de la confédération suisse, et du FFG

LinkedIn: @project MICROCARD

Twitter: @P_Microcard

Latest news

WP3/5 meeting in Berlin

On 16 and 17 March, Participants in work packages 3 and 5 met at the Zuse Institute in Berlin to discuss the state of research and software development in space and time discretizations as well as preconditioners. Concrete implementation aspects were also discussed.

Mmg release 5.7.0

Mmg version 5.7.0 was released in December, including features that are crucial for the MICROCARD project, such as 64-bit integers and several improvements in the isosurfacing functionality.

MICROCARD Periodic Report submitted

On 30 November we submitted the first of our two Periodic Reports to EuroHPC. This report covers the first 18 months of the project.

Ginkgo release 1.5.0

Version 1.5.0 of the Ginkgo library for sparse linear algebra on CPUs and GPUs was released. It includes several improvements relevant to the MICROCARD project.


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Agenda

Friday 24 March

14:00 WP7 meeting

Monday 27 March

15:30 WP1 meeting

Friday 31 March

10-17 Review preparation meeting


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