Modélisation numérique de l'électrophysiologie cardiaque au niveau de la cellule

Le projet européen MICROCARD vise à construire un logiciel capable, grâce à l'utilisation des futurs supercalculateurs exaflopiques, de simuler le comportement électrique d'un cœur entier modélisé cellule par cellule. Ce projet est financé par EuroHPC à travers de l'appel Towards Extreme Scale Technologies and Applications.

Résumé

La contraction cardiaque est coordonnée par un système complexe d'activation électrique. Des anomalies structurelles du myocarde, même microscopiques, désorganisent cette activation et peuvent avoir des conséquences graves, allant jusqu'à la mort subite, y compris chez des sujets jeunes et apparemment sains. La modélisation numérique est un élément clé pour la compréhension de ces événements. L'étude d'un tissu anormal demande cependant une description individuelle des cellules et donc des calculs d'une complexité telle qu'on ne peut espérer réaliser ces calculs que sur la prochaine génération de supercalculateurs, dits «exaflopiques». Le but de ce projet est de développer des outils permettant de bénéficier de ces machines pour simuler l'activité électrique d'un cœur entier mais décrit cellule par cellule. Le projet regroupe des mathématiciens, informaticiens, biophysiciens, et ingénieurs biomédicaux. Il constitue un cas test pour les méthodes de pointe en simulation numérique et renforce la lutte contre les maladies cardiaques.

Financement

Logotypes de l'Agence Nationale de Recherche,
 du Research Council of Norway, du German
 Federal ministry of education and research, du EuroHPC joint union, de l'union européenne,
 du Ministero dello sviluppo economico, de la confédération suisse, et du FFG

LinkedIn: @project MICROCARD

Twitter: @P_Microcard

Latest news

MICROCARD restarts in November 2024

The MICROCARD project ended on 30 September but MICROCARD will be reborn as a Centre of Excellence on 1 November 2024. It will be funded by EuroHPC call HORIZON-EUROHPC-JU-2023-COE-03.

25 September 2024: Thesis defense Arun Thangamani

Arun Thangamani successfully defended his thesis "Optimized Code Generation of Parallel and Polyhedral Loop Nests using MLIR" at the University of Strasbourg. This is the first thesis supported completely by the MICROCARD project.

September 2024: Three meetings in southern Germany

MICROCARD members participated in three consecutive cardiac physiology/computing meetings that took place in southern Germany.

4-6 September: the Virtual Physiological Human (VPH) meeting in Stuttgart.

8-11 September: the Computing in Cardiology (CinC) meeting in Karlsruhe.

12-14 September: the Cardiac Physiome combined with the final MICROCARD workshop in Freiburg.

Together these meetings saw over two dozen MICROCARD contributions, an appropriate goodbye to the project which formally ends on 30 September.


more news

Agenda

1 November

MICROCARD restarts as a Centre of Excellence

Thursday 7 November

16:00 MICROCARD-2 EB meeting

11-13 November

openCARP user meeting in Graz, Austria

Thursday 28 November

Final review meeting of the MICROCARD project in Luxembourg


full agenda

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