Computersimulatie van de cardiale elektrofysiologie op cellulaire schaal

MICROCARD is een Europees onderzoeksproject dat tot doel heeft om software te ontwikkelen waarmee de elektrische activiteit van het hart gesimuleerd kan worden met sub-cellulaire resolutie. Vanwege de enorme schaal van dit probleem zal deze software geschikt zijn voor gebruik op toekomstige exascale supercomputers. Het project wordt gefinancierd door EuroHPC call Towards Extreme Scale Technologies and Applications.

Hartziekten zijn de belangrijkste doodsoorzaak in de wereld, en de helft van deze overlijdens wordt veroorzaakt door problemen in het elektrische activatiesysteem van het hart. Om beter inzicht te krijgen in deze problemen maken onderzoekers onder andere gebruik van computermodellen. Deze modellen zijn echter nog niet krachtig genoeg om alle (2 miljard!) spiercellen van het hart individueel weer te geven. Ze moeten daarom aannemen dat honderden spiercellen ongeveer hetzelfde gedrag vertonen. Deze aanname maakt het onmogelijk om ziekten te simuleren waarbij de microstructuur van het weefsel is aangetast. Recent onderzoek laat zien dat zulke ziekten veel voorkomen.

Om zulke ziekten met een computermodel te simuleren zijn supercomputers nodig die veel krachtiger zijn dan de huidige generatie. Zulke "exascale" machines zullen in de komende jaren worden geïnstalleerd in Europa. Deze machines zullen echter veel moeilijker te programmeren zijn dan huidige computers. Bovendien is een model met individuele hartcellen moeilijker op te lossen dan de nu gebruikelijke modellen. Binnen het MICROCARD project zal daarom samengewerkt worden tussen informatici, wiskundigen en biomedisch ingenieurs om software te ontwikkelen die dit probleem efficient kan oplossen op de zeer grootschalige machines die in aantocht zijn. Zij zullen bovendien samenwerken met cardiologen en fysiologen om de software te testen met de medisch relevante problemen waarvoor ze bedoeld is. Twee Europese top-instituten op het gebied van elektrische hartziekten zijn betrokken bij dit project: IHU Liryc in Bordeaux en het Universitäts Herzzentrum in Freiburg.

Financiering

Dit project wordt gefinancierd door de European High-Performance Computing Joint Undertaking EuroHPC met subsidienummer 955495.

EuroHPC projecten worden voor de helft gefinancierd door EuroHPC en voor de andere helft door de landen die deelnemen aan het project, in dit geval Frankrijk, Duitsland, Italië, Zwitserland, Noorwegen en Oostenrijk.

Logo's van de organisaties die het project financieren: ANR
 in Frankrijk, The Research Council of Norway, het Duitse ministerie van onderwijs en onderzoek,
 het Italiaanse ministerie van economische ontwikkeling, de Zwitserse federatie, en de FFG in
 Oostenrijk.

LinkedIn: @project MICROCARD

Twitter: @P_Microcard

Latest news

Workshop completed

MICROCARD had its first on-site workshop on 6 and 7 July at the Liry institute in Bordeaux.

Open positions

We are looking for an engineer and a postdoc to work on meshing tools and a research software engineer to work on software integration.

MICROCARD is touring Europe

In June, the MICROCARD project was presented at the Teratec Forum 2022 on 14 and 15 June in Paris, and at the HiPEAC meeting in Budapest on June 20–22. We also presented results at the ECCOMAS meeting in Oslo, the ISC High Performance meeting in Hamburg, and the CMBE meeting in Milan.


more news

Agenda

31 July-5 August

15th World Congress on Computational Mechanics & 8th Asian Pacific Congress on Computational Mechanics (WCCM-APCOM 2022), Yokohama, Japan

Wednesday 3 August

16:00 WP3 meeting

Wednesday 10 August

15:00 implementation taskforce meeting

26-29 August

European Society of Cardiology meeting in Barcelona


full agenda

website powered by Dutch windmills • no cookies • all browsers welcome