|
||||||||
|
Numeriske simuleringer av hjertets elektrofysiologi ned mot cellenivåMICROCARD er et europeisk forskningsprosjekt for å bygge programvare som kan simulere hjertets elektrofysiologi ved hjelp av helhjertemodeller med subcellular oppløsning, på fremtidige eksascale superdatamaskiner. Den er finansiert av EuroHPC call Towards Extreme Scale Technologies and Applications. Prosjektet starter i april 2021. SammendragKardiovaskulær sykdom er den hyppigste årsaken til død i hele verden, og halvparten av slike kardiovaskulære dødsfall skyldes hjertearytmi som opptrer når de elektriske impulsene i hjertet ikke fungerer normalt og dermed ødelegger hjertets elektriske synkroniseringssystem. Matematiske modeller, samt simuleringer av disse modellene på datamaskin, er veldig viktige for å forstå det elektriske synkroniseringssystemet og hvorfor syke tilstand oppstår. I dag er allerede avanserte matematiske modeller brukt i forskning, men disse modellene er ikke i stand til å studere alle individuelle cellene i hjertet (ca. 2 milliard celler). Derfor må forskerne ty til en kraftig tilnærming og nøye med mye lavere oppløsninger i simuleringene. Dagens matematiske modeller kan f.eks. ikke forklare sykdommens forløp i aldrende og strukturelt syke hjerter, hvor en redusert elektrisk kobling kan føre til store forskjeller mellom naboceller, som har en potensielt dødelig konsekvens. For å kunne modellere og dermed simulere de individuelle cellene i et helt hjerte, må vi takle et matematisk problem som er ca. 10000 ganger større og vanskeligere å løse enn dagens standard. Vi trenger derfor mye kraftigere superdatamaskiner samt nye oppfinnelser som kan sikre en effektiv bruk av disse superdatamaskinene. Hovedmålet til prosjekt MICROCARD er å utvikle programvare som kan brukes til å løse dette ekstremt utfordrende problemet på fremtidige exascale superdatamaskiner. Vi skal også lage nye numeriske algoritmer som er spesielt tilpasset det underliggende matematiske problemet, og som passer for fremtidens ultrakraftige datamaskiner. Vi vil ikke nøye oss med et "proof of concept", men skal bruke den utviklede programvaren til å løse realistiske problemer innen kardiologi. Suksess til prosjektet vil være basert på et velfungerende team av dataeksperter, matematikere og biomedisinske ingeniører, støttet av et samarbeid med kardiologer og fysiologer. Finansiering![]() |
LinkedIn: @project MICROCARD Twitter: @P_Microcard Latest newsMICROCARD Periodic Report submittedOn 30 November we submitted the first of our two Periodic Reports to EuroHPC. This report covers the first 18 months of the project. Ginkgo release 1.5.0Version 1.5.0 of the Ginkgo library for sparse linear algebra on CPUs and GPUs was released. It includes several improvements relevant to the MICROCARD project. Aslak Tveito to step downAslak Tveito, CEO of our partner Simula, will step down from his position in January 2023 to spend more time on research. Simone Pezzuto to TrentoMICROCARD member Simone Pezzuto left our partner USI to become an assistant professor at Università di Trento. He will maintain a relationship with USI that allows him to stay with the project. AgendaMonday 23 January15:30 WP1 meeting Wednesday 25 January15:00 Implementation taskforce meeting Thursday 26 January10:30 WP2+6 meeting Friday 27 January14:00 WP7 meeting Wednesday 1 February14:30 WP4+5 meeting Wednesday 8 February11:00 WP3 meeting Thursday 9 February16:00 Executive Board meeting |
||||||
website powered by Dutch windmills • no cookies • all browsers welcome |