Computersimulatie van de cardiale elektrofysiologie op cellulaire schaal

MICROCARD is een Europees onderzoeksproject dat tot doel heeft om software te ontwikkelen waarmee de elektrische activiteit van het hart gesimuleerd kan worden met sub-cellulaire resolutie. Vanwege de enorme schaal van dit probleem zal deze software geschikt zijn voor gebruik op toekomstige exascale supercomputers. Het project wordt gefinancierd door EuroHPC call Towards Extreme Scale Technologies and Applications.

Hartziekten zijn de belangrijkste doodsoorzaak in de wereld, en de helft van deze overlijdens wordt veroorzaakt door problemen in het elektrische activatiesysteem van het hart. Om beter inzicht te krijgen in deze problemen maken onderzoekers onder andere gebruik van computermodellen. Deze modellen zijn echter nog niet krachtig genoeg om alle (2 miljard!) spiercellen van het hart individueel weer te geven. Ze moeten daarom aannemen dat honderden spiercellen ongeveer hetzelfde gedrag vertonen. Deze aanname maakt het onmogelijk om ziekten te simuleren waarbij de microstructuur van het weefsel is aangetast. Recent onderzoek laat zien dat zulke ziekten veel voorkomen.

Om zulke ziekten met een computermodel te simuleren zijn supercomputers nodig die veel krachtiger zijn dan de huidige generatie. Zulke "exascale" machines zullen in de komende jaren worden geïnstalleerd in Europa. Deze machines zullen echter veel moeilijker te programmeren zijn dan huidige computers. Bovendien is een model met individuele hartcellen moeilijker op te lossen dan de nu gebruikelijke modellen. Binnen het MICROCARD project zal daarom samengewerkt worden tussen informatici, wiskundigen en biomedisch ingenieurs om software te ontwikkelen die dit probleem efficient kan oplossen op de zeer grootschalige machines die in aantocht zijn. Zij zullen bovendien samenwerken met cardiologen en fysiologen om de software te testen met de medisch relevante problemen waarvoor ze bedoeld is. Twee Europese top-instituten op het gebied van elektrische hartziekten zijn betrokken bij dit project: IHU Liryc in Bordeaux en het Universitäts Herzzentrum in Freiburg.

Financiering

Dit project wordt gefinancierd door de European High-Performance Computing Joint Undertaking EuroHPC met subsidienummer 955495.

EuroHPC projecten worden voor de helft gefinancierd door EuroHPC en voor de andere helft door de landen die deelnemen aan het project, in dit geval Frankrijk, Duitsland, Italië, Zwitserland, Noorwegen en Oostenrijk.

Logo's van de organisaties die het project financieren: ANR
 in Frankrijk, The Research Council of Norway, het Duitse ministerie van onderwijs en onderzoek,
 het Italiaanse ministerie van economische ontwikkeling, de Zwitserse federatie, en de FFG in
 Oostenrijk.

Latest news

Project workshop

Our first project workshop is planned on 4 February 2021. It will take place online and we hope for an in-person meeting in the summer.

Open positions

There are three positions currently open on our jobs page.

Friday 10 December 2021

Our first two conference abstracts have been submitted!

Tuesday 31 August 2021

MICROCARD is covered in the latest edition of the ETP4HPC handbook of European High-Performance Computing Projects.


more news

Agenda

Monday 24 January 2022

15:00 WP1 meeting

Tuesday 25 January 2022

14:00 WP4+5 meeting

Friday 4 February 2022

10:00-11:00 WP3 meeting

13:00-17:00 MICROCARD Workshop

Tuesday 8 February 2022

14:00-15:30 EB meeting

23-26 February

SIAM meeting on parallel processing in Seattle, WA, USA


full agenda

website powered by Dutch windmills • no cookies • all browsers welcome